O Laboratório de Ensaios Especiais (LEE), em Castelo Branco, é o único laboratório equipado para fazer ensaios ATP (Indústria de Alimentos Perecíveis) em tuneis termodinâmicos assim como homologação de equipamentos de frio.
No LEE estão as maiores instalações laboratoriais do País no que diz respeito a Ensaios Estruturais, ensaios de Termo Vácuo e ensaios de Vibrações num shaker eletrodinâmico. É o Laboratório do ISQ mais bem preparado para desenvolver ensaios experimentais à medida tendo, por isso, clientes de todo o país e de vários países europeus.
Este laboratório concluiu com sucesso, há poucas semanas, uma campanha de ensaios dinâmicos num protótipo de um satélite de Observação da Terra. Neste momento está em curso, em paralelo, várias campanhas de ensaios para o ITER, o reator experimental de fusão nuclear que vai ser construído em França.